结合国内企业发表的实体瘤MRD科研文献,对该领域进行更全面的分析,并简要梳理代表企业的专利与科研特点



上一期(国内实体瘤 MRD 发展全景①:专利趋势、技术路线与玩家梳理),我们从专利层面分析了国内实体瘤MRD企业及其技术路线特点。但仅凭专利尚难以看清全局。

本期结合国内企业发表的实体瘤MRD科研文献,对该领域进行更全面的分析,并简要梳理代表企业的专利与科研特点。



01

文献发表情况概览

检索2020年至今PubMed数据库收录的MRD科研文献,按以下标准筛选:

纳入标准:国内企业参与发表的实体瘤MRD文献。

排除标准:

①文献综述及系统综述;

②核心研究目的为新药/靶向药/免疫药的疗效或安全性评估,且MRD仅作为辅助检测指标、非核心评估目的的研究;

③动物研究。

注:本次所使用的检索词为:("Minimal Residual Disease"[Title/Abstract] OR "Measurable Residual Disease"[Title/Abstract] OR "Molecular Residual Disease"[Title/Abstract] OR MRD[Title/Abstract]) AND (2020/01/01:2026/12/01[dp]) 

按照以上策略,共检索确定国内企业参与发表的实体瘤MRD文献82篇,涉及27家公司(检索难免有遗漏,仅供参考,表1)。

其中,有10家公司同时拥有相关专利申请(见表1,公司名称标蓝者代表有专利申请)。这些企业可能是当前国内实体瘤MRD检测最核心的玩家。

综合专利与文献信息,国内已申请实体瘤MRD检测专利或有相关文献发表的企业合计55家(见附录)。

从时间变化趋势看,2020—2023年间,国内企业参与发表的实体瘤MRD文献数量快速增长,与专利申请数量的变化趋势一致。

图1 2020-2026 国内公司参与发表的文献数量变化趋势

进一步分析已发表文献对癌种的覆盖情况(见表1),与既往专利分析相比,文献覆盖的癌种更加丰富。

表1 2020-2026年国内公司参与发表的实体瘤MRD文献及覆盖癌种

注:1、来源于Pubmed数据库,未对文献质量做进一步区分;2、只反映企业布局情况,文献数量不能完全代表企业在该方向实力特点。3、公司名称中标记蓝色代表其同步有专利申请。

除多癌种外,共涉及14类癌种,在上一期专利覆盖的癌种之外,新增关注的癌种包括:肝癌、神经母细胞瘤、头颈部肿瘤、卵巢癌、骨肉瘤、黑色素瘤、脑干胶质瘤等。

在技术路线层面,基于NGS的ctDNA突变检测仍是最核心的技术方向。其他技术中,除上一期盘点的qPCR和dPCR技术、以及常见标志物外,还包括以下特殊研究:

  • 美国赛特公司采用SE‑iFISH(差相富集‑免疫荧光原位杂交)方法检测循环肿瘤细胞(CTC),开展了喉癌和黑色素瘤的研究。

  • 深圳市瑞格生物科技有限公司采用多级过滤型确定性侧向位移(DLD)微流控芯片结合免疫荧光标记,检测CTC并探讨其与MRD的关系,用于神经母细胞瘤的预后评估。

  • 燃石医学参与发表1篇基于脑脊液ctDNA突变与甲基化特征进行脑胶质瘤MRD检测的研究。

  • 云翔医疗联合美国mProbe曾发表1篇基于代谢组的结直肠癌MRD检测。

  • 鹍远基因联合国内临床团队,依托多重 ctDNA 甲基化荧光定量 PCR技术,完成 Ⅰ~Ⅲ 期结直肠癌 MRD 早期检出与复发风险分层的前瞻性临床研究,该成果 2023 年正式发表于 JAMA Oncology。


02

代表企业专利与文献特点分析

一、吉因加

吉因加的代表性研究成果主要与广东省人民医院团队合作,围绕肺癌MRD领域完成从早期到晚期的系列研究:

  • 早期术后(Cancer Discovery,2022):证实纵向不可检测MRD可定义潜在治愈人群,MRD阴性患者可能无需辅助治疗。

  • 局晚期放化疗(Cancer Cell,2023):发现早期ctDNA清零患者预后更好,持续MRD阴性者为潜在治愈人群。

  • 晚期靶向治疗(JAMA Oncology,2024):首次证明ctDNA指导的降阶梯TKI策略使75%驱动基因阳性患者获益“药物假期”,中位假期9.1个月,再治疗有效率96%且无严重不良反应。

专利方面,从查询到的专利看,主要侧重保护“个性化探针 + 固定panel”的探针设计路线,已获授权专利锁定了固定探针组的优先级筛选算法(CN117144003B)、个性化探针组的定制与排序流程(CN117144002B)、针对非小细胞肺癌的具体探针组成分及序列(CN118932064B),以及基于拷贝数与克隆比例校正的ctDNA定量模型(CN117604086B);

正在申请中的专利则进一步涉及提升探针集覆盖效率的评估指标与筛选方法(CN121075423A)。

二、世和基因

世和基因在实体瘤MRD方向的代表性研究主要覆盖肺癌和结直肠癌:

  • 2021年 J Hematol Oncol 发表结直肠癌MRD研究:240例II-III期患者连续ctDNA分析,识别复发准确率92%,比影像学提前5.01个月发现复发。

  • 2022年 J Hematol Oncol 发表早期NSCLC术后MRD研究(与南京医科大学等合作):证实术后7天ctDNA阳性可识别高复发风险,纵向监测比影像学提前145天预警,克隆突变预后价值更高。

  • 2021年 Nature Communications 发表NSCLC辅助化疗决策研究(与中国医学科学院肿瘤医院等合作):证实II-III期术后ctDNA阳性患者可从辅助化疗获益,阴性者复发风险低,ctDNA比影像学提前88天预警。

专利方面,不考虑其他液体活检专利,关注cfDNA序列特征是其主要差异方向:

  • cfDNA序列与片段特征方向:不依赖已知突变,直接从cfDNA物理或序列特征建模。已授权CN115678999B(基于WGS片段长度比例的复发预测);申请中CN122090931A(利用Transformer对cfDNA端到端学习)、CN122050500A(融合肿瘤信息训练语言模型,推理时计算“癌症片段预测占比”)。三者从人工定义的片段组学特征发展到深度学习自动特征提取,形成梯度布局。

  • 算法与噪音抑制方向:已授权CN119943142B,通过蒙特卡洛模拟计算p值,区分真实信号与背景噪音。

  • 特定癌种/标志物方向:CN116042920A(针对HPV宫颈癌设计探针捕获)、CN115862737A(组合TP53失活突变与ctDNA-MRD状态预测NSCLC复发)。

三、燃石医学

燃石医学在实体瘤MRD方向的代表性研究主要围绕食管鳞状细胞癌和非小细胞肺癌:

2023年 Cancer Cell 发表早期NSCLC术后MRD研究(与北京大学人民医院等合作):患者特异性预后与潜在治疗标志物追踪技术(PROPHET)灵敏度更高,中位比影像学提前299天预警复发;整合MRD状态提出的TNMB分期显著改善预后预测。

2025年 Molecular Cancer 发表可切除食管鳞状细胞癌(OSCC)围手术期研究(与复旦大学附属中山医院等合作):围手术期免疫联合化疗是该类患者的可行且安全选择;通过ctDNA监测MRD,可能对系统性评估辅助治疗效果和预后具有潜在价值。

燃石目前正在申请的实体瘤MRD专利CN117672507A是2023年发表文献技术的延伸,特点在于利用ctDNA在多个时间点的占比及其动态变化率,结合纵向数据和生存数据评估癌症复发风险,解决ctDNA定量动态变化在长期监测中的应用空白。其方法通过体细胞突变位点与背景突变位点的分析精准检测ctDNA占比,并构建动态定量变化模型(如PROPHET JB模型),输出肿瘤复发风险程度值。

03

总结

近五年来,国内实体瘤MRD检测技术发展迅速,专利申请与文献发表数量均呈现快速增长。结合本次检索结果,国内至少有55家集团或企业拥有相关专利申请或参与发表过科研文献,其中核心玩家约10家左右。

在技术路线上,已形成以tumor-informed策略、基于探针捕获NGS的ctDNA突变检测为主流的技术方法,也有博尔诚、鹍远基因等企业选择基于甲基化的qPCR检测策略,亦有dPCR、免疫荧光原位杂交等技术策略。

在标志物选择方面,近年来甲基化标志物、片段组学、miRNA、单细胞、代谢物等新型标志物的研究,为基于多组学的实体瘤MRD检测提供了新思路。

在癌种覆盖上,目前已至少涉及14类癌种。其中,肺癌、结直肠癌、食管鳞状细胞癌已有高质量前瞻性队列研究或临床试验发表,肺癌的研究成果最为丰富,结直肠癌次之,但目前仍缺乏高质量随机对照临床试验成果。

需要指出的是,当前主流策略下,实际应用中仍面临检测成本高、流程复杂等固有局限。如何在性能与成本之间找到最佳平衡点,仍是该领域未来产品突破的关键方向。

附录:有实体瘤MRD专利申请或文献发表的企业(按字母排序)

注:标记蓝色代表同步有文献发表和专利申请。专利检索中未考虑除MRD外其他液体活检专利。


收藏

评论列表 共有 0 条评论

暂无评论
返回
顶部